El tomate no es una verdura por la sencilla razón de que una verdura es cualquier parte de una planta que sea comestible y no sea un fruto. En el caso del tomate, sí que es un fruto, por tanto, es una fruta.
Aparte de lo comentado anteriormente, tienes algunos errores en la oración, de tal manera que se escribiría así correctamente:
«Mi pensas, ke la tomato estas legomo, ne frukto».