मैं नहीं रो रही! तुम रो रहे हो!
मैं प्याज़ काट कर रहा हूँ!
Could this also be "Why are you crying?"
Nope. 'क्या' means 'what'. Your sentence would be translated into 'तूम क्यों रो रही हो?'
निंजा प्याज़ काट रही हैं