Mi pensas, ke "Kiel fartas vin?" ankau estas korekta.
Pardonu min! Kiel fartas vi?
"Kiel vi fartas?" ou "Kiel fartas vi?" são ambos corretos?
Acredito que nessa frase, de forma isolada, sim. Existe essa liberdade não esperanto. Mas em uma frase maior existem outras regras da gramática que podem influenciar numa escrita diferente.